Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERCC2P18074 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms