Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPB42P16452 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
EPB42P16452 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms