Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BRAFP15056 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRAFP15056 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms