Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYH1P12882 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYH1P12882 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYH1P12882 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYH1P12882 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms