Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRCP08575 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRCP08575 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRCP08575 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PTPRCP08575 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTPRCP08575 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTPRCP08575 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PTPRCP08575 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPRCP08575 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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