Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC4A1P02730 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC4A1P02730 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms