Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
IGKV3-15P01624 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IGKV3-15P01624 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms