Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LDLRP01130 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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