Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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