Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREB3O43889 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB3O43889 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms