Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TO15178 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TO15178 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TO15178 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TO15178 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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