Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLGNO14967 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLGNO14967 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms