Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EBAG9O00559 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EBAG9O00559 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms