Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC4-APOC2K7ER74 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms