Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms