Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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LINC00587B1AMM8 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00587B1AMM8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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