Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LCHNA4D1U4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms