Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms