Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRBV2A0A0J9YWF9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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TRBV2A0A0J9YWF9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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