Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HDGFL3Q9Y3E1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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