Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAB39Q9Y376 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAB39Q9Y376 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CAB39Q9Y376 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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