Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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RAB23Q9ULC3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB23Q9ULC3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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