Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTNAP2Q9UHC6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms