Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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