Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC180Q9P1Z9 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms