Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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COMMD8Q9NX08 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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