Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EMILIN3Q9NT22 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms