Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CISHQ9NSE2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CISHQ9NSE2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms