Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHST12Q9NRB3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms