Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PFDN4Q9NQP4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PFDN4Q9NQP4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms