Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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ELL3Q9HB65 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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ELL3Q9HB65 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ELL3Q9HB65 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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