Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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KLHL4Q9C0H6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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