Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP1Q9C000 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NLRP1Q9C000 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms