Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TDRD1Q9BXT4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms