Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRIP1Q9BX63 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms