Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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