Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FYCO1Q9BQS8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms