Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOL4Q9BPW4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOL4Q9BPW4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms