Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PRPF18Q99633 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRPF18Q99633 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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