Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LGMNQ99538 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LGMNQ99538 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms