Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ULK4Q96C45 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ULK4Q96C45 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms