Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C6Q969F1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms