Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHTF2Q8N3S3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHTF2Q8N3S3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms