Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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