Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms