Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms