Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD4Q5VX71 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD4Q5VX71 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms