Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRIP1Q5VSL9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms