Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGSNQ5TDP6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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