Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAPCD1Q5SSQ6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAPCD1Q5SSQ6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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